Dit museum is ondergebracht in vier synagogen uit de 17e en 18e eeuw. Het laat de geschiedenis zien van de Joden in Nederland vanaf 1600 tot nu: het leven binnen de gemeenschap, de commerciële activiteiten, bijzondere personen waaronder de filosoof Spinoza (1632-1677) en de verschrikkelijke Tweede Wereldoorlog. In de Tweede Synagoge is een museum voor kinderen ingericht: hier wordt de Joodse religie gepresenteerd aan de hand van het interieur van een familie.